Ein Versöhnungsversuch von John Constantine und Zatanna endet nur vorläufig in einem Hotelzimmer in Paris. Beide erwachen anschließend an unterschiedlichen Orten. Während Zatanna im Haus der Mysterien zu sich kommt und dort den erbosten Deadman, Swamp Thing und Nightmare Nurse erklären muss, warum es diese ebenfalls gegen ihren Willen dorthin verschlagen hat, sieht sich Constantine mit dem weiblichen Avatar des Hauses der Geheimnisse konfrontiert. Dieser berichtet ihm von einer bevorstehenden Auseinandersetzung mit seinem Gegenpart, der sein Bewusstsein in alle Häuser der Erde und von dort aus in ihre Bewohner übertragen und so den ganzen Planeten zum Haus der Mysterien machen will. Das Haus der Geheimnisse will dieses Vorhaben durch einen Präventivschlag vereiteln und stellt dem Hellblazer Frankenstein, Andrew Bennett, Black Orchid und Madame Xanadu zur Seite.
In der Zwischenzeit begegnen Zatanna und ihre Mitstreiter dem männlichen Avatar des Hauses der Mysterien, der ihnen eine völlig andere Geschichte erzählt. So kommt es zur unvermeidlichen Konfrontation beider Teams. Diese setzt gewaltige Kräfte frei, die beide Häuser für einen mächtigen Zauber verwenden, der sie zum Haus der Wunder verschmelzen lässt. Als solches ergreifen sie gemeinsam Besitz von der Erde und der Vereinigungszauber kann erst gebrochen werden als Zatanna John Constantine die Erinnerung an ihre gemeinsame Liebe nimmt. Mit dem Aussprechen des K'Am'Deva-Fluchs fehlt dem Zauber das verbindende Glied und das Haus der Wunder vergeht. Wahrend Constantine auf der Erde zurückbleibt, werden die weiteren Mitglieder der Liga in Raum und Zeit versetzt.
Zatanna verschlägt es in eine Zeit vor der Zeit, in der die Magie ungleich stärker ausgeprägt ist als in der Gegenwart. Dort trifft sie auf ihre Familie und ein jüngeres Ich ihrer selbst. Als sie erkennt, dass es sich bei ihrem Vater lediglich um eine Manifestation ihrer Wünsche handelt, endet die Illusion.
Am Ende der Zeit treffen Frankenstein, Swamp Thing, Nightmare Nurse und Andrew Bennett auf einen mutierten Felix Faust, der das letzte Lebewesen einer vergehenden Welt ist. Nachdem es zu einer Verständigung mit dieser missgestalteten Lebensform gekommen ist, stellt sich heraus, dass es sich lediglich um einen Ableger des wahren Felix Faust handelt. Dieser erscheint und greift - völlig wahnsinnig geworden - die Liga an. Als sein eigener Ableger ihn angeht, kann Nightmare Nurse einen Schutzzauber sprechen und mit ihren Gefährten entkommen. Als die Reste der Welt untergehen, stranden sie inmitten der Nicht-Zeit.
Madame Xanadu, Deadman und Black Orchid finden sich an einem Ort ohne Zeit wieder, der nach Aussage seines Herrschers Arif weder betreten noch verlassen werden kann. Während er die Magierin umgarnt versuchen deren Begleiter einen Weg aus diesem ewig währenden Augenblick zu finden. Ein solcher bietet sich als Madame Xanadu Arif küsst und diesem so das Geschenk der Vergänglichkeit bereitet. Mit dem sterbenden König vergeht auch sein Reich der Stasis, dem die Zeit gebracht wurde.
Auf der Suche nach den anderen Mitgliedern der Liga begegnet Zatanna einer Manifestation des Weltenbaumes, der sie an den Ort versetzt an dem sich die Gesuchten nach ihren Erlebnissen in den Weiten von Raum und Zeit nun gesammelt aufhalten. Die in der Nicht-Zeit Gestrandeten wurden von einer pflanzenartigen Erscheinung erfasst als sich ihr Schutzzauber aufzulösen begann und die im ewigen Königreich Gefangenen hatte es nach dem Ende dieser Welt hierhin verschlagen. Hier am Anbeginn der Zeit erschafft der Weltenbaum das Haus der Mysterien neu und stellt dies der Liga als neue Basis zur Verfügung. Anschließend versetzt er das Haus in das Herz von Chronos, dem Zentrum aller Zeit.
Zatanna gelingt es die dort entstandenen Risse im Zeitstrom zu reparieren. Dies ruft mit Pralaya jedoch die Manifestation der Leere, des Ur-Nichts auf den Plan. Diese beabsichtigt alle Schöpfung wieder in sich aufzunehmen und nur mittels eines Tempus Duratus - eines Zaubers, der die Zeit anhält - gelingt es Madame Xanadu und Nightmare Nurse das Ende allen Seins aufzuhalten. Von Pralaya erfahren sie nun, dass es der K'Am'Deva-Fluch war, der die Grenze zwischen der Schöpfung und der bereits vor ihr existierenden Leere aufriss und Pralaya diesen Umstand nun für ihre Zwecke nutzen will. Nach dieser Eröffnung beendet Zatanna den Schutzzauber, der die Liga bislang davor bewahrte von der Leere aufgenommen zu werden und mit der Liga endet alles...
...zurück bleibt nur das neu geschaffene Haus der Mysterien und sein seltsamer Gast - ein von Zatanna erschaffenes Spiegelbild des Hellblazers. Diesem wiederum gelingt es ein geistiges Abbild Zatannas zu erschaffen und gemeinsam mit diesem im Treibhaus einen Avatar des Grüns zu erzeugen. Diese drei müssen sich nun ebenfalls der auf sie aufmerksam gewordenen Pralaya stellen, die sich nun kurz vor ihrem Ziel wähnt. Während Constantine und Zatanna die Manifestation der Leere ablenken dringt der Avatar des Grüns in diese ein. Mit sich führt er einen Samen des Weltenbaums und dieser erwächst so aus der Leere. Mit dem Weltenbaum wird auch das Universum wieder hergestellt und außer der Justice League Dark und dem Weltenbaum Ouroboros weiß niemand von diesem Vorgang und der zweiten Chance die die Schöpfung so erhalten hat.
Das Haus der Mysterien landet auf der Erde, direkt vor den Füßen des von Erde-2 zurückgekehrten "echten" Constantine. Zatanna übergibt ihm das Haus und die Mitglieder der Liga gehen wieder getrennte Wege.
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